IBM携手长春藤名校 向癌症“开刀”

刀片服务器连接麻省综合医院、哈佛大学和麻省理工计算网格。

日前，IBM与麻省综合医院（MGH，哈佛医学院教学医院）共同宣布，双方正在合作开发一个基于网格的分布式计算基础架构，以促进癌症研究人员之间的合作和信息共享。该网格系统是由IBM麻省和剑桥研究所的计算机专家们与来自麻省综合医院 Martinos生物医学成像中心的著名癌症专家Thomas Deioeck博士（哈佛大学和麻省理工学院卫生科学与技术部成员）合作，共同开发出的高性能计算机网格，以提高信息共享水平。该系统通过先进的脑瘤建模及模拟技术，帮助科研人员在癌症研究领域取得新突破。

该网格系统由位于哈佛大学和麻省理工学院内的IBM eServer p系列超级计算机所组成的Crimson网格，连接位于IBM剑桥研究所中的多台IBM eServer BladeCenter刀片服务器。

IBM互联网技术部工程师David Groman表示：“通过与底层计算及数据基础架构的紧密整合，有效的信息管理工具能够帮助生命科学领域的研究人员找到解决复杂问题的新途径。此外，我们还利用语义网技术，依靠高级建模算法对各种资源和不同格式的数据进行整合。这种方法在如此大规模的合作项目中，发挥了至关重要的作用。”

今年10月，包括Deioeck博士在内的9位医学专家获得了美国国家癌症研究所（NCI）提供的1490万美元资金支持，用于开展综合性癌症生物学项目（IC）的研究。该项目由多个医疗机构共同参与，采用基因组学、蛋白质组学、分子成像等领域的大量新技术及方法，设计数学模型，实现计算机模拟，改善对肿瘤生长过程的研究。

Deioeck博士表示：“为了实现对癌症进行复杂动态系统建模的目标，我们迫切需要一个公共统一的基础平台，来对包括异构数据和不同计算工具在内的癌症相关信息进行整合并实现共享。随着癌症研究的不断深入和新技术的问世，大量全新的数据和观点已经涌现。但是由于缺乏共享系统及标准，使得这些关键信息的整合过程变得极其困难。”

正是出于对癌症综合模型重要性的认识，NCI启动了IC项目。同时，NCI也意识到，癌症科研人员和机构之间由于缺乏公共的技术标准和工具，难以实现有效的信息共享，这大大阻碍了对抗癌症研究的发展和进步。

美国国家癌症研究所癌症生物学部副主任Dan Gallahan表示：“对于NCI来说，许多重要工作都必须在公私合营的模式下，利用各个学科领域内不同机构的力量才能够完成。这一点在抗癌研究中体现得最充分。”

在今后的三到五年中，IBM还将同Deioeck博士以及由国际知名专家组成的工作组合作，共同开发一种多尺度“虚拟肿瘤”。它能对肿瘤从最早期的单细胞成长为包含数百万关联细胞的集合体的过程进行模拟，其目的是为了更深入地了解各种肿瘤的生长模式，并最终实现肿瘤的成功预测和防治。

除此之外，IBM还为麻省综合医院提供了一个基于Linux系统的高清晰度电视墙，配备高达920万像素的显示器，满足高级肿瘤建模所需的可视化功能要求。