癌症元凶—PIK3CA酶的三维图像
2019-06-10 抗癌健康网
专注健康 关爱生命人们经常说到一张图片能解千言万语,这对于生物学研究来说尤其正确,近期来自约翰霍普金斯医学院生物物理及生物物理化学系,霍德华休斯医学院Ludwig癌症遗传与治疗中心(the Ludwig Center for Cancer Genetics and Therapeutics)等处的研究人员构建了一张在许多类型的癌症中突变的一种酶的三维图像,帮助科学家们了解了这种癌症“元凶”的最常见突变如何导致癌症生长的。这一研究成果公布在Science杂志上。
领导这一研究的是约翰霍普金斯医学院癌症中的Sandra B. Gabelli和L. Mario Amze,以及霍德华休斯医学院的Bert Vogelstein,文章第一作者是黄传详(Chuan-Hsiang Huang,音译,生物谷注)。
“现在我们获得了这种蛋白的更完整图像,并且了解这种蛋白在癌症中如何变化的,这样就能从中研发用于癌症治疗的突变特异性抑制因子。”
这种酶称为PIK3CA,其编码基因在之前的研究中发现与结肠癌等多种癌症发病存在相关性,32%的结肠癌患者体内基因PIK3CA存在突变。在成胶质细胞瘤、胃癌、乳腺癌和肺癌患者中,这一基因存在突变的比例分别为27%、25%、8%和4%。
PIK3CA属于一种脂质激酶编码基因——脂质激酶对细胞的生长、形状变化和运动等能够发挥指导作用。研究显示,PIK3CA基因的突变主要发生在肿瘤即将侵入其他组织的时候,这种基因突变可能会导致脂质激酶活性增强,引发一系列细胞变化,使正常细胞的生长失去控制,结果产生癌变。
Amzel表示,“我们希望能了解这种酶的活性如何受到基于其长度位置的突变的影响的”,“但是没有三维结构,这很难做到,就像是缺失了关键的一块拼图。”
因此研究小组纯化分离了PIK3CA,以及PIK3CA正常绑定的其它部分蛋白,利用X-射线衍射技术得到了这种经纯化的酶与其它partner蛋白结合的结构,并分析得到了3-D结构。利用计算机数据,研究人员分析了X-射线模式,组合成了三维模式,这样研究人员就可以描绘所有癌症相关突变了。
Sandra B. Gabelli介绍道,研究人员最初认为这种突变可能干扰了PIK3CA与其它蛋白,以及细胞部件的相互作用,因此一定存在于这种酶的外部表面上。但是,研究结果显示几乎所有的突变都是发生在酶的内部,“这些内部突变通过某种方式引起了蛋白细微的改变,从而导致其功能及内部相互作用的变化”,“要想了解什么样的细微的形状和结构变化导致酶更好的行使功能是一个有趣的问题,通常我们研究的是为什么功能丧失了。”
研究小组目前正致力于解释PIK3CA突变的结构,希望能比较突变与正常蛋白的区别,从而能更好的理解突变如何引发癌症的,另外一个研究目的就是寻找能特异性干扰PIK3CA的药物,用于抗癌治疗。
生物谷推荐原始出处:
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The Structure of a Human p110/p85 Complex Elucidates the Effects of Oncogenic PI3K Mutations
Chuan-Hsiang Huang,1,3 Diana Mandelker,2 Oleg Schmidt-Kittler,2 Yardena Samuels,2* Victor E. Velculescu,2 Kenneth W. Kinzler,2 Bert Vogelstein,2 Sandra B. Gabelli,1 L. Mario Amzel1
PIK3CA, one of the two most frequently mutated oncogenes in human tumors, codes for p110, the catalytic subunit of a phosphatidylinositol 3-kinase, isoform (PI3K, p110/p85). Here, we report a 3.0 angstrom resolution structure of a complex between p110 and a polypeptide containing the p110-binding domains of p85, a protein required for its enzymatic activity. The structure shows that many of the mutations occur at residues lying at the interfaces between p110 and p85 or between the kinase domain of p110 and other domains within the catalytic subunit. Disruptions of these interactions are likely to affect the regulation of kinase activity by p85 or the catalytic activity of the enzyme, respectively. In addition to providing new insights about the structure of PI3K, these results suggest specific mechanisms for the effect of oncogenic mutations in p110 and p85.
1 Department of Biophysics and Biophysical Chemistry, Johns Hopkins University School of Medicine, Baltimore, MD 21205, USA.
2 Ludwig Center for Cancer Genetics and Therapeutics, and Howard Hughes Medical Institute at the Johns Hopkins Kimmel Cancer Center, Baltimore, MD 21231, USA.
3 Graduate Program in Immunology, Johns Hopkins University School of Medicine, Baltimore, MD 21205, USA.
* Present address: National Human Genome Research Institute, National Institutes of Health, Bethesda, MD 20892, USA.
To whom correspondence should be addressed. E-mail: mamzel@jhmi.edu (L.M.A.); gabelli@jhmi.edu (S.B.G.); vogelbe@jhmi.edu (B.V.)