SARS-CoV-2感染过程中唾液RT-PCR敏感性的变化

        虽然鼻咽拭子上的实时逆转录酶-聚合酶链反应 (RT-PCR) 是 SARS-CoV-2 检测的当前标准，但由于易于收集和最低供应要求，唾液是诊断和筛查的有吸引力的替代方法。 对基于唾液的 SARS-CoV-2 分子检测敏感性的研究显示出相当大的可变性。研究人员进行了一项前瞻性纵向研究，以调查优化唾液检测 SARS-CoV-2 敏感性的检测时间范围。

　　方法

　　在2020年6月17日至2021年2月15日期间，从洛杉矶儿童医院和附近的社区检测点招募了一组在2周内通过RT-PCR证实的SARS-CoV-2暴露于家庭成员的个人样本，纳入家庭暴露和呼吸道病毒传播及免疫研究（HEARTS）。每3至7天采集一对鼻咽和唾液样本，持续4周或直到2次鼻咽试验结果呈阴性。对SARS-CoV-2 N1和N2基因进行RT-PCR；周期阈值小于40定义为阳性结果。鼻咽N1周期阈值小于等于34被定义为高病毒载量。

　　以鼻咽阳性RT-PCR为参考标准计算唾液敏感性。COVID-19的发病定义为首次症状（通过每日问卷调查收集）或首次RT-PCR阳性之间的较早日期。症状前和症状后分别定义为症状间隔前后的无症状时间点。采用χ2检验或Fisher精确检验比较收集周唾液的敏感性以及有症状和无症状个体之间的唾液敏感性。广义估计方程用于确定鼻咽阳性对唾液敏感性相关的临床特征，同时考虑来自相同个体的重复样本。使用SPSS 27.0版（IBM公司）进行分析，采用双侧P?<?.05被认为是重要的。获得参与者的书面知情同意书。这项研究得到了洛杉矶儿童医院机构审查委员会的批准。

　　结果

　　我们测试了来自 404 名参与者的 889 对鼻咽拭子唾液样本，其中在 524 份鼻咽（58.9%）和 318 份唾液（35.7%）样本中检测到了 SARS-CoV-2。 在 258 对 (29.0%) 的两个样本中均检测到 SARS-CoV-2。 在 256 名鼻咽 SARS-CoV-2 阳性参与者 (63.4%) 中，平均年龄为 28.2 岁（范围 3.0-84.5 岁）； 108 (42.2%) 名男性。 参与者返回的中位数为 3 次访问（四分位距，2-4）。 93 名参与者 (36.3%) 在整个感染过程中都没有出现症状； 163 名有症状的个体中有 126 名 (77.3%) 报告病情轻微。

　　在感染第一周收集的样本中，唾液敏感性最高，为 71.2%（95% CI，62.6%-78.8%），但随后每周都会下降。在感染第 1 周的标本采集日出现 COVID-19 相关症状的参与者与无症状参与者相比，唾液敏感性显着更高（88.2% [95% CI, 77.6%-95.1%] vs 58.2% [95% CI , 46.3%-69.5%]；P < .001)。 在第 2 周，有症状的参与者的唾液敏感性仍然显着更高（83.0% [95% CI, 70.6%-91.8%] vs 52.6% [95% CI, 42.6%-62.5%]；P < .001）。在 COVID-19 发病后超过 2 周未观察到差异。无症状 (34.7% [95% CI, 27.3%-42.7%])、症状前 (57.1% [95% CI, 31.7%-80.2%]) 和症状后 (42.9% [95%CI，36.8%-49.1%]）时间点的敏感性没有显着差异（P = .26）。

　　在 COVID-19 发病后的每一天，与前一天相比，唾液检测的优势比为 0.94（95% CI，0.91-0.96）（P < .001）。 在标本采集时出现 COVID-19 相关症状或鼻咽病毒载量高的参与者分别为 2.8（95% CI，1.6-5.1；P < .001）和 5.2（95% CI，2.9-9.3；P < .001)与无症状或鼻咽病毒载量低的患者相比，唾液RT-PCR结果阳性的几率更高。

　　讨论

　　在感染的最初几周内，唾液对有症状的个体检测SARS-CoV-2是敏感的，但在所有时间点，无症状的SARS-CoV-2携带者的敏感性都低于60%。由于工作场所、学校和其他共享空间的新冠病毒检测策略得到了优化，因此必须考虑无症状感染患者唾液的低敏感性。这项研究表明，基于唾液的RT-PCR不应用于无症状新冠病毒的筛查。

　　这项研究有局限性。 样本是在家庭接触后收集的； 因此，前测概率很高。 鼻咽拭子检测是参考标准，但这并不是 SARS-CoV-2 感染的完美检测，感染 10 天后任何样本的 RT-PCR 阳性结果可能无法预测病毒复制或传染性。